New junction evidence | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_013198 | 21939 = | NA (NA) | 26 (0.046) | 11/180 | 11.8 | intergenic (‑16/‑181) | is2/LGG_00023 | transposase IS5 family protein/metal‑dependent membrane protease |
? | NC_013198 | 21999 = | 226 (0.361) | intergenic (‑76/‑121) | is2/LGG_00023 | transposase IS5 family protein/metal‑dependent membrane protease | ||||
Continuation Left: 0 Continuation Right: 0 | ||||||||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
Only 100 of 550 total aligned reads displayed.
AAACTATAAAAGTACTTTAATAATAGGATTTACCAATAGTTCGGCGTATAATAAGTGCAACCCTTATTTGCCCGAAATGCCTATGCTTTGGGATTTACCCTTGCACTTAT.................................................................................................... < NC_013198/22038‑21939
....................................................................................................TTGCACTTATTATACGCCGAACTATTGGTAAATCCTATTATTAAAGTACTTTTATAGTTTTTCACCATCCACTAAATATCAGCTATTATTTCTATATACAGAACTGATCG > NC_013198/21999‑22108
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TAAAAGTACTTTAATAATAGGATTTACCAATAGTTCGGCGTATAATAAGTGCAACCCTTATTTGCCCGAAATGCCTATGCTTTGGGATTTACCCTTGCACT < 7:54610/101‑1
TAAAAGTACTTTAATAATAGGAGTTACCAATAGTTCGGCCTATAATAAGTGCAACCCTTATTTGCCCCAAATGCCTAGGCTTTGGGATTTACCCTTGCACT < 1:999410/101‑1
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AAACTATAAAAGTACTTTAATAATAGGATTTACCAATAGTTCGGCGTATAATAAGTGCAACCCTTATTTGCCCGAAATGCCTATGCTTTGGGATTTACCCTTGCACTTAT.................................................................................................... < NC_013198/22038‑21939
....................................................................................................TTGCACTTATTATACGCCGAACTATTGGTAAATCCTATTATTAAAGTACTTTTATAGTTTTTCACCATCCACTAAATATCAGCTATTATTTCTATATACAGAACTGATCG > NC_013198/21999‑22108
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 16 ≤
ATCG
< 28 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|