BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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TTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCGAGACTTTCGACAAAT  >  NC_013198/1998800‑1999006


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       aTAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGt                                                                                                     <  7:82239/101‑1


       aTAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....TGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAAtt                                                                                                 <  12:1083920/101‑2


         aaTGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTT........GGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  28:966915/101‑1


         aaTGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTT........GGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  27:1023117/101‑1


            gCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGt                                                                                                <  10:883270/101‑1


             cTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....TGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  19:1135570/101‑1


             cTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....TGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  4:1135570/101‑1


             cTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....TGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  9:22783/101‑1


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               gTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTA..ATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  23:421105/101‑1


                ttAGCAATTGCAAACACGATTTA.CTATCAATTTTGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  8:183727/101‑1


                ttAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAt                                                                                            <  13:174260/101‑1


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                 tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATTGTAAtt                                                                                           <  29:1178731/101‑1


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                 tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  20:819970/101‑1


                 tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  20:14632/101‑1


                 tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCGTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  7:354475/101‑1


                 tAGAAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTCGCTGTACTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTAAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  16:917524/101‑1


                   gCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGTCTTTTCTCCTTATGGCTGACTAACGCCACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGt                                                                                         <  8:482736/101‑1


                   gCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGt                                                                                         <  10:599583/101‑1


                    cAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTa                                                                                        <  2:577953/101‑1


                     aaGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGAACCACCTATAATGTTAACCCCTTTAATTGTAATGTTAATTGTAt                                                                                       >  17:138130/1‑101


                      aGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTAtt                                                                                      <  26:739231/101‑1


                      aGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTAtt                                                                                      <  27:511502/101‑1


                      aGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTAtt                                                                                      <  3:162868/101‑1


                      aGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTAtt                                                                                      <  18:162868/101‑1


                       gTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTc                                                                                     <  28:586283/101‑1


                           aGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCt                                                                                 <  1:369615/101‑1


                              cacGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGtt                                                                              <  13:440577/101‑2


                                   tGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACa                                                                         >  6:551503/1‑101


                                    gTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACaa                                                                        >  4:646917/1‑101


                                    gTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACaa                                                                        >  19:646917/1‑101


                                     tatttattCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAAt                                                                       <  9:569178/101‑1


                                      atttattCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATg                                                                      <  21:50603/101‑1


                                        ttattCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGAt                                                                    <  11:559505/101‑1


                                        ttattCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGAt                                                                    <  27:158187/101‑1


                                        ttagtCATTGTGCTGTTCTCCTTAGGTCAGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATTTTAATTGTATTCATCTTTCAGACAATGAt                                                                    <  17:348093/101‑1


                                            tCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGAt                                                                <  22:1201050/101‑1


                                             cATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATg                                                               >  5:481844/1‑101


                                              aTTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGt                                                              <  7:1249269/101‑1


                                                    cTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTAtttt                                                        <  14:143561/101‑1


                                                         ctcCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAg                                                   <  12:237043/101‑1


                                                                       cTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGc                                     <  25:844485/101‑1


                                                                            gACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACACTGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGgaga                                >  16:378902/1‑101


                                                                             acacAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGagat                               >  10:132304/1‑101


                                                                               acaACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAGTGTATTCATCTGGCAGACAATGATAGAGGGTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGagatag                             >  19:997050/1‑100


                                                                               acaACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAGTGTATTCATCTGGCAGACAATGATAGAGGGTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGagatag                             >  4:997050/1‑100


                                                                                  aCTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTGTTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGagataagat                          >  25:370059/1‑101


                                                                                  aCTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGagataagat                          <  29:851288/101‑1


                                                                                    tataATGTTAATCACTATAACTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAg                        <  23:811014/101‑1


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                                                                                      taATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGGTAGAc                      >  30:153310/1‑101


                                                                                      taATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGAc                      <  6:1105938/101‑1


                                                                                              aCCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCgaga              >  16:649302/1‑101


                                                                                                      aaTTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCGAGACTTTCGAc      >  12:85896/1‑101


TTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATTCATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCGAGACTTTCGACAAAT  >  NC_013198/1998800‑1999006

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 20 ≤


ATCG

< 30 ≤


ATCG

< 35 ≤


ATCG

< 41 ≤


ATCG