Sat Aug 18 20:50:37 2012 breseq --require-match-fraction 0.99 --reference ../NC_013198.1.gbk 05_1_00 05_1_01 05_1_02 05_1_03 05_1_04 05_1_05 05_1_06 05_1_07 05_1_08 05_1_09 05_1_10 05_1_11 05_1_12 05_1_13 05_1_14 05_3_00 05_3_01 05_3_02 05_3_03 05_3_04 05_3_05 05_3_06 05_3_07 05_3_08 05_3_09 05_3_10 05_3_11 05_3_12 05_3_13 05_3_14