| New junction evidence | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_013198 | 1998841 = | 2252 (2.867) | 36 (0.048) | 15/192 | 9.5 | intergenic (+434/‑243) | lciIC/LGG_01955 | XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein |
| ? | NC_013198 | = 1998844 | 2296 (2.923) | intergenic (+437/‑240) | lciIC/LGG_01955 | XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein | ||||
| Continuation Left: 0 Continuation Right: 4 | ||||||||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | ||||||||||
Only 100 of 2380 total aligned reads displayed.
TCGACGTTGGTCGCGGGTGAGACTTTCGCAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATA > NC_013198/1998741‑1998941
|
tCGACGTTGGTCGCGGGTGAGACTTTCGCAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGtattt > 16:876523/1‑101
tCGACGTTGGTCGCGGGTGAGACTTTCGCAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGtattt > 2:876523/1‑101
aactataatgttaaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGtatttat > 14:327778‑M1/28‑101
ctataatgttaaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....c > 11:927733‑M1/26‑101
aatgttaaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CAttt > 20:864691‑M1/22‑101
aatgttaaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CAttt > 19:821868‑M1/22‑101
aatgttaaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CAttt > 5:821868‑M1/22‑101
tgtgaaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTgg > 8:155564‑M1/20‑101
taaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTg > 16:262176‑M1/17‑101
taaccactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTg > 2:262176‑M1/17‑101
accactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGtt > 20:13339‑M1/15‑101
accactataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGtt > 6:555481‑M1/15‑101
tataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCt > 1:30519‑M1/10‑101
tataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCt > 15:30519‑M1/10‑101
ataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCtt > 1:1244488‑M1/9‑101
ataattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCtt > 15:1244488‑M1/9‑101
taattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTa > 23:136365‑M1/8‑101
aattgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTAt > 7:572415‑M1/7‑101
ttgtAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATgg > 25:1239355‑M1/5‑101
AATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGa > 26:704240‑M1/1‑101
TGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACt > 7:218973‑M1/1‑101
aGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACg < 27:770037/101‑1
tGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATaa < 27:1066200/101‑1
tCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAAtt < 3:31163/101‑2
tCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAAtt < 17:31163/101‑2
tCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATg < 10:243700/101‑1
aaGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGtt < 8:55243/101‑1
aaGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGtt < 20:376445/101‑1
atatTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAAcc < 5:1097452/101‑1
atatTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAAcc < 15:483643/101‑1
atatTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAAcc < 19:1097452/101‑1
atatTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAAcc < 1:483643/101‑1
ttttGCTCGATAATGCTGTTATCAAGTGCAGACTCGATGTATTTATTTATTCATTTGGCTTGT.CTCCTTATGGCTTACTAACGACACAACTATAATGTTaa < 25:423198/100‑1
tGCTCGATATTGCTGTTAGCAAGTGCAGACACTATTTATTTATT....CTTTTGTCTGTT.CTCCTTATGGTTGATTACCTACACAACTATAATGTTAACCACtat < 23:779971/101‑1
cTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATaa < 20:608363/101‑1
cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAtt < 27:1235384/101‑1
cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAtt < 10:509526/101‑1
cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAtt < 5:286017/101‑1
cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAtt < 19:286017/101‑1
cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAtt < 12:1246025/101‑1
cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAtt < 10:1019216/101‑1
cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAtt < 9:498739/101‑1
gATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTg < 13:379115/101‑1
aTAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT........TGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.tt < 17:1189789/101‑2
aTAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT........TGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.tt < 3:1189789/101‑2
aaTGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaa > 28:110779‑M2/1‑99
aaTGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaa > 2:548330‑M2/1‑99
aaTGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaa > 16:548330‑M2/1‑99
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatt > 25:694394‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatt > 2:1186174‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatt > 22:939298‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatt > 22:263226‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatt > 16:1186174‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatt > 21:973337‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatt > 11:1218871‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatg > 18:475283‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatg > 27:430932‑M2/1‑97
tGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatg > 4:475283‑M2/1‑97
gCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.t < 10:824421/101‑1
tGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgcca > 24:941363‑M2/1‑94
tGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgcca > 25:998492‑M2/1‑94
gTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTag < 18:205997/101‑2
gTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTag < 4:205997/101‑2
gTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTaa > 6:328150/1‑101
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TT.GTAAtt < 13:965303/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TT.GTAAtt < 1:896299/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TT.GTAAtt < 15:896299/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 6:802395/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 13:65840/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 13:1023942/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 7:1059830/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 12:381238/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 28:413073/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 11:388046/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 26:1911/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 21:312610/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 21:610978/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 24:304996/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 24:1068658/101‑1
tAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 23:570952/101‑1
aGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 17:50555/101‑1
aGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 3:50555/101‑1
aGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TGATTAAtt < 13:1193506/101‑1
cAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGTCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.T...TAATTGTAtt < 24:573707/101‑1
cAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgccagccgct > 8:868345‑M2/1‑88
aaGTGCAGACACGATGTATTTATTTATTCATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAAtt < 21:1130833/101‑1
aaGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgccagccgctg > 12:635886‑M2/1‑87
aaGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgccagccgctg > 3:969346‑M2/1‑87
aaGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgccagccgctg > 17:969346‑M2/1‑87
aGTGCAGACACGATGTATTTATTTATTCATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAAATG.TTAAtt < 4:738177/101‑1
aGTGCAGACACGATGTATTTATTTATTCATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAAATG.TTAAtt < 18:738177/101‑1
aGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAATTGTAtt < 6:1112753/101‑1
acacGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAATTGTATTCATCTGt < 5:506611/101‑1
acacGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAATTGTATTCATCTGt < 19:506611/101‑1
acGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgccagccgctggtaatgtcaa > 11:637685‑M2/1‑77
gATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAATTGTATTCATCTGTCAGa > 7:895383/1‑101
tGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgccagccgctggtaatgtcaagcat > 9:1179380‑M2/1‑73
gTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTaatgccagccgctggtaatgtcaagcata > 22:686580‑M2/1‑72
gTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAATTGTATTCATCTGTCAGACaa > 9:721144/1‑101
tatttatt....CATTTGGCTGTT.CTCCTGATTGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTTTAA.TG.TTAATTGTATTCATCTGTCAGACAAt < 26:413491/101‑1
|
TCGACGTTGGTCGCGGGTGAGACTTTCGCAATGCCAGCCGCTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTT.CTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAA.TG.TTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATA > NC_013198/1998741‑1998941
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|