| New junction evidence | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_013198 | 1998770 = | 432 (0.567) | 30 (0.039) | 12/194 | 10.4 | intergenic (+363/‑314) | lciIC/LGG_01955 | XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein |
| ? | NC_013198 | = 1998901 | 2278 (2.900) | intergenic (+494/‑183) | lciIC/LGG_01955 | XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein | ||||
| Continuation Left: 0 Continuation Right: 0 | ||||||||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | ||||||||||
Only 100 of 2314 total aligned reads displayed.
AGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTA......TAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCGAGACTTTCG > NC_013198/1998793‑1999000
|
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tGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACta......t < 2:15609/101‑1
tGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACta......t < 21:406817/101‑1
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gCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACta......ta < 27:242682/101‑1
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tCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTA......TAAt < 11:19939/101‑1
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tGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTA......TAATTGTaatgcca > 21:1243848‑M2/1‑94
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aaGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTA......TAATTGTaatgccagccgctg > 12:635886‑M2/1‑87
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gCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTA......TAATTGTaatgccagccgctggtaatgtcaagcatatttgctcgataatgc > 22:936649‑M2/1‑57
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a......taATTGTAATGTTAATTGTATTAATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCGAGACTTTCg > 1:680927/1‑101
|
AGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTA......TAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCGAGACTTTCG > NC_013198/1998793‑1999000
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|