| New junction evidence | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_013198 | 1998770 = | 450 (0.796) | 94 (0.166) | 32/192 | 4.5 | intergenic (+363/‑314) | lciIC/LGG_01955 | XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein |
| ? | NC_013198 | = 1998886 | 1820 (3.090) | intergenic (+479/‑198) | lciIC/LGG_01955 | XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein | ||||
| Continuation Left: 0 Continuation Right: 0 | ||||||||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | ||||||||||
Only 100 of 1876 total aligned reads displayed.
CTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGAC > NC_013198/1998781‑1998986
|
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aTGTCAAGCATATTTGCTTGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACtata < 14:145066/101‑1
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gTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTTTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAAt < 14:107586/101‑1
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cATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAAc < 15:827478/101‑1
cATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAAc < 4:827478/101‑1
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tCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATCTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAAt < 7:1224530/101‑1
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aTTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTAAAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGCCAATGATAGATGt > 19:234360/1‑101
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|
CTGGTAATGTCAAGCATATTTGCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGAC > NC_013198/1998781‑1998986
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|