New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew annotation gene product
* ? NC_013198 1998770 =NA (NA)2262 (4.001) 94/192 0.6 intergenic (+363/‑314) lciIC/LGG_01955 XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein
?NC_013198 = 1998907 NA (NA)intergenic (+500/‑177) lciIC/LGG_01955 XRE family transcriptional regulator/reverse transcriptase‑like protein
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GCTCGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....CATTTGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAATTGTATTCATCTGTCAGACAATGATAGATGTTATTTTCGAAGCAGTGTATCCCTGCGGAGATAAGATAGACAGGCGAGACTTTCGACAAAT  >  NC_013198/1998802‑1999006
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   cGATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT....C............TCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAATGTTAAtt                                                                                           <  12:659848/101‑1
    gATAATGCTGTTAGCAAGTGCAGACACGATGTATTTATT........TGGCTGTTCTCCTTATGGCTGACTAACGACACAACTATAATGTTAACCACTATAATTGTAAt                                                                                                  <  1:936356/101‑1
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Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 16 ≤  ATCG  < 28 ≤  ATCG  < 34 ≤  ATCG  < 41 ≤  ATCG