New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew annotation gene product
* ? NC_013198 1873857 =0 (0.000)8 (0.084) 5/290 7.8 intergenic (‑53/‑48) LGG_01843/LGG_01844 hypothetical protein/hypothetical protein
?NC_013198 = 1873978 75 (0.763)coding (74/177 nt) LGG_01844 hypothetical protein
Continuation Left: 0 Continuation Right:0
Rejected: Position hash score below cutoff.

CGAACGGTCGGGCAACGTGAACCGACGCGCTTAGAAATCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTGCGCCGGGGAGCG  .  NC_013198/1873842‑1874006
               |                                                                                                                                                     
acgcgttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTc                <  2:94366/136‑1
  gcgttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCtc              >  2:56107/14‑150
  gcgttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTg              >  1:850742/14‑151
  gcgttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTg              >  1:881988/14‑151
  gcgttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTg              >  2:863183/14‑151
   cgttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCACGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGCTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTgc             >  2:72271/13‑151
   cgttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTgc             >  1:925107/13‑151
    gttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTgcg            >  1:663119/12‑151
     ttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTgcgc           <  1:466337/141‑1
     ttatggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTgcgc           <  2:974231/141‑1
       atggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTGCGCCg         >  2:731624/9‑151
        tggtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTGCGCCgg        >  1:590417/8‑151
          gtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTGCGCCgggg      <  1:747918/146‑1
          gtgagcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTGCGCCgggg      <  2:730790/146‑1
              gcGTGAACCAGCCCGGTTAGAAACCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTGCGCCGGGGAgcg  >  1:941149/2‑151
               |                                                                                                                                                     
CGAACGGTCGGGCAACGTGAACCGACGCGCTTAGAAATCGGAGCATAAGTGGCCTTGGGCGTGATGACCGGGCTTTGGTCATTGCGCCCAAGGTCCTTATGTGCAGGTTTCTGGGCTGGCGAACGCGTTATGGTGAGCGTGATCCGACTTCTGCGCCGGGGAGCG  .  NC_013198/1873842‑1874006

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 19 ≤  ATCG  < 28 ≤  ATCG  < 33 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG